В 2016 году Канцелярии президента Эстонии на текущие расходы было выделено 4,4 миллиона бюджетных денег. Основная статья расходов - содержание персонала, обеспечивающего работу президента республики. Всего при Канцелярии президента работают 60 человек, а на оплату их труда в этом году было потрачено 2 миллиона евро.
Кроме того, Канцелярия президента распределяет выделенные из бюджета деньги на содержание хозяйства и недвижимости, а также на транспортные расходы. При этом за покупку президентского автомобиля отвечает Департамент полиции и погранохраны, поэтому эта статья расходов не входит в бюджет Президентской канцелярии, а цена автомобиля засекречена из соображений безопасности. В последний раз новый президентский автомобиль был куплен в 2016 году.
Сам президент получает зарплату в 5200 евро в месяц, то есть на его зарплату государство тратит 80 000 евро в год. После того, как президент покидает свой пост, он имеет право на пенсию в размере 75% от президентской зарплаты, а после его смерти пенсию в 50% от зарплаты президента может получать его жена.